Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
E9PCH4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
E9PCH4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
E9PCH4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
E9PCH4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
E9PCH4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
E9PCH4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
E9PCH4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
E9PCH4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.19
E9PCH4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
E9PCH4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
E9PCH4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
E9PCH4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
E9PCH4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
E9PCH4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
E9PCH4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
E9PCH4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
E9PCH4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
E9PCH4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
E9PCH4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
E9PCH4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
E9PCH4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
E9PCH4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
E9PCH4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
E9PCH4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
E9PCH4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
E9PCH4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
E9PCH4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
E9PCH4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
E9PCH4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
E9PCH4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
E9PCH4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
E9PCH4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
E9PCH4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
E9PCH4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
E9PCH4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
E9PCH4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
E9PCH4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
E9PCH4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
E9PCH4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
E9PCH4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
E9PCH4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
E9PCH4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
E9PCH4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
E9PCH4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
E9PCH4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
E9PCH4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
E9PCH4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
E9PCH4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
E9PCH4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
E9PCH4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
E9PCH4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
E9PCH4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
E9PCH4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
E9PCH4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
E9PCH4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
E9PCH4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
E9PCH4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
E9PCH4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
E9PCH4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
E9PCH4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
E9PCH4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
E9PCH4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
E9PCH4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.17
E9PCH4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
E9PCH4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
E9PCH4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
E9PCH4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
E9PCH4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
E9PCH4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
E9PCH4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
E9PCH4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
E9PCH4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
E9PCH4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
E9PCH4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
E9PCH4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
E9PCH4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
E9PCH4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
E9PCH4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
E9PCH4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
E9PCH4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
E9PCH4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
E9PCH4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
E9PCH4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
E9PCH4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
E9PCH4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
E9PCH4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
E9PCH4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
E9PCH4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
E9PCH4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
E9PCH4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
E9PCH4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms