Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1110002E22RikE0CYV9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1110002E22RikE0CYV9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
1110002E22RikE0CYV9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1110002E22RikE0CYV9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.8 ms