Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp6ap1lD3Z5W0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1lD3Z5W0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms