Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
4930407I10RikD3Z5T8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
4930407I10RikD3Z5T8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
4930407I10RikD3Z5T8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
4930407I10RikD3Z5T8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
4930407I10RikD3Z5T8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
4930407I10RikD3Z5T8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms