Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim12cD3Z3L3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim12cD3Z3L3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim12cD3Z3L3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms