Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3C6

Zfand4, AN1-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfand4D3Z3C6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfand4D3Z3C6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfand4D3Z3C6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfand4D3Z3C6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfand4D3Z3C6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms