Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
3425401B19RikD3Z1D3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
3425401B19RikD3Z1D3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
3425401B19RikD3Z1D3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
3425401B19RikD3Z1D3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
3425401B19RikD3Z1D3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms