Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm6685D3YYP3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm6685D3YYP3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6685D3YYP3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms