Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700015F17RikD3YUK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700015F17RikD3YUK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms