Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrc5C3VPR6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc5C3VPR6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.7 ms