Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6133B2RY53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6133B2RY53 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6133B2RY53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms