Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGB1P1B2RPK0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms