Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPBD1B2RD01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPBD1B2RD01 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPBD1B2RD01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms