Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Scn7aB1AYL1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scn7aB1AYL1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scn7aB1AYL1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Scn7aB1AYL1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms