Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nfx1B1AY10 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nfx1B1AY10 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nfx1B1AY10 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nfx1B1AY10 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms