Protein–RNA interactions for Protein: B1AXH1

Nhsl2, NHS-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl2B1AXH1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhsl2B1AXH1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhsl2B1AXH1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhsl2B1AXH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhsl2B1AXH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nhsl2B1AXH1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nhsl2B1AXH1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms