Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nipsnap3aB1AWZ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms