Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD1B0YJ81 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD1B0YJ81 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HACD1B0YJ81 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD1B0YJ81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD1B0YJ81 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD1B0YJ81 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD1B0YJ81 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD1B0YJ81 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD1B0YJ81 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD1B0YJ81 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.3 ms