Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BECN2A8MW95 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BECN2A8MW95 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN2A8MW95 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms