Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1P1A8MUH7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1P1A8MUH7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms