Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PP2D1A8MPX8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PP2D1A8MPX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PP2D1A8MPX8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms