Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN24A6NM45 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN24A6NM45 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN24A6NM45 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN24A6NM45 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN24A6NM45 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms