Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3P2A6NIE6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRN3P2A6NIE6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRN3P2A6NIE6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms