Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRABD2BA6NFA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2BA6NFA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABD2BA6NFA1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms