Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6L4A6NEF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L4A6NEF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms