Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperbA2RTF1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatsperbA2RTF1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatsperbA2RTF1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms