Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fibcd1A2AV25 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fibcd1A2AV25 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fibcd1A2AV25 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms