Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm27029A2A4P4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm27029A2A4P4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm27029A2A4P4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.2 ms