Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J235

TRAV13-2, T-cell receptor alpha variable 13-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV13-2A0A0B4J235 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAV13-2A0A0B4J235 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAV13-2A0A0B4J235 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAV13-2A0A0B4J235 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms