Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.4 ms