Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.63■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms