Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp5Q9Z2P8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms