Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tulp1Q9Z273 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp1Q9Z273 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp1Q9Z273 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp1Q9Z273 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms