Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cpne6Q9Z140 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cpne6Q9Z140 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne6Q9Z140 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne6Q9Z140 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms