Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr1h3Q9Z0Y9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1h3Q9Z0Y9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h3Q9Z0Y9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms