Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIAS3Q9Y6X2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIAS3Q9Y6X2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms