Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.35
LAMC3Q9Y6N6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC42.16■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
LAMC3Q9Y6N6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC42.08■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
LAMC3Q9Y6N6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
LAMC3Q9Y6N6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC42■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC41.98■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.95■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
LAMC3Q9Y6N6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms