Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB4Q9Y5E5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB4Q9Y5E5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB4Q9Y5E5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB4Q9Y5E5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHB4Q9Y5E5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHB4Q9Y5E5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB4Q9Y5E5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB4Q9Y5E5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms