Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC42Q9Y546 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC42Q9Y546 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms