Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXND1Q9Y4D7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXND1Q9Y4D7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXND1Q9Y4D7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms