Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolbQ9WVP6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PapolbQ9WVP6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolbQ9WVP6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms