Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkraQ9WTX2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkraQ9WTX2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkraQ9WTX2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms