Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ggps1Q9WTN0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ggps1Q9WTN0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ggps1Q9WTN0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggps1Q9WTN0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms