Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPS5Q9UPZ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HPS5Q9UPZ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HPS5Q9UPZ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms