Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SORCS3Q9UPU3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORCS3Q9UPU3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms