Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSR3Q9UNL2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSR3Q9UNL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 584.1 ms