Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMPRSS11EQ9UL52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS11EQ9UL52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS11EQ9UL52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms