Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF346Q9UL40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF346Q9UL40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF346Q9UL40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms