Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDV3Q9UKY7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDV3Q9UKY7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDV3Q9UKY7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms