Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD3Q9UJU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD3Q9UJU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms